قرر الرئيس محمد مرسي تحويل المسؤولين عن حادث قطار أسيوط إلى النيابة العامة، وأكد أنه سيحاسب كل من كان السبب فيه، ووجه بسرعة الإنجاز في اكتشاف ومعرفة سبب هذا الحادث الأليم، وذلك من خلال التحقيقات السريعة.
وأعرب مرسي، في كلمة متلفزة، عن تعازيه لأسر ضحايا حادث تصام قطار بأتوبيس مدرسة في محافظة أسيوط، وقال: تابعت وبكل الحزن والأسى الحادث الأليم الذي وقع صباح اليوم لمجموعة من أبنائنا عند مزلقان المندرة التابعة لمنفلوط بمحافظة أسيوط، وبالأصالة عن نفسي وبالنيابة عن الشعب المصري أتقدم بخالص العزاء لأسر الضحايا والمصابين.
كما قرر الرئيس قبول استقالة وزير النقل والمواصلات، وكذلك رئيس هيئة السكك الحديدية، واتخاذ كافة الإجراءات من قبل الجهات التنفيذية المختلفة، لتعويض أسر الضحايا والمصابين، والتواصل معهم وتذليل كافة العقبات.